2000年5月,屡遭兴奋剂重创的中国泳坛再次爆出重大新闻——200米个人混合泳世界纪录保持者、世锦赛冠军吴艳艳涉嫌服用兴奋剂。吴艳艳是在济南举行的中国游泳冠军赛暨奥运选拔赛上,被查出服用兴奋剂的。这次比赛,吴艳艳在她的强项200米个人混合泳的比赛中,一改近年来的颓势,游出了2分14秒02的成绩,名列当年世界第3。在短短的时间内成绩提高如此之快,当时就有人提出质疑。5月底,游泳队接到通知,吴艳艳被告之A瓶尿检结果呈阳性,谜团随之被解开,吴艳艳服用的是当时国际上非常流行的兴奋剂:诺龙。由于吴艳艳一直拒不承认服用禁药,中国兴奋剂检测中心又对其B瓶尿样进行了检测,结果同样呈阳性,吴艳艳服用兴奋剂事件“罪证确凿”。
2000年,大名鼎鼎的长跑“马家军”被查出多人血检超标,从而被取消了参加奥运会的资格,其中包括名将董艳梅。2001年,“马家军”主力队员宋丽清、尹丽丽等人因被查出服用兴奋剂或违反兴奋剂检查规定,又遭到田管中心禁赛处罚。
在这十多年的时间中,田径和游泳一直是兴奋剂的重灾区,2011年和杨春雷和李季等田径选手也因为兴奋剂问题被禁赛。2003年的第五届城运会上又有李慧泉和郑永吉等田径选手掉入了“尿瓶子”。而在2003年的举重世锦赛上,举重选手尚世春被查出服用了违禁药物,受到禁赛两年的惩罚;之前相对干净的足球赛场上,张帅在这一年成为了首位因为禁药而被禁赛的甲A足球选手。
2004年的雅典奥运会,中国摔跤选手高延芝和射击选手王夏芃都因为服用禁药而受到了停赛两年的惩罚。在2005年的“十运会”上则发生了著名的孙英杰“厕所捡药”事件——女子中长跑名将孙英杰在女子万米决赛后尿检呈阳性,被处以两年禁赛处罚。事后孙英杰称自己是在天安门广场东北角的一个公厕捡到了一个蓝布小挎包,“不知情而喝下了里面装的东西”,所以导致尿检呈阳性。