据台湾媒体报道，台“交通部”的统计资料显示，去年金门及马祖“小三通”航线进出船舶达8594艘，平均每天就有23.5艘船班进出，较2004年增加37.9%，其中货轮有4328艘次，客轮有4186艘次，客货轮有80艘次，其中大陆船舶达5410艘，占总数的63%，台方船舶占3184艘，占总数的37%。

　　去年“小三通”往返旅客总数达56万人次，较2004年增加28.1%，其中台方旅客达51.6万人次，大陆旅客达3.86万人次，大陆旅客往返总人数较2004年大幅成长62.5%，而统计由2001年“小三通”首航至今，已有7万人次大陆旅客利用“小三通”航线往返两岸。

　　在货物运量方面，2005年“小三通”进出港货物达164万吨，较去年增加79.4%，其中由大陆输往台方的货物达163.9万公吨，台方输往大陆的货物有1100余公吨。其中，大陆输往金马的货物以砂石建材为主，台方透过“小三通”销往大陆的货品为酒及贡糖等杂货类商品。